国家卫生健康委重点实验室作为国家卫生健康科技创新体系的重要组成部分，始终以维护和保障人民健康为目的，面向卫生健康事业发展、面向生物医学科技创新前沿，聚焦行业重大需求，解决行业关键问题，获取自主创新成果，培育创新人才队伍，促进卫生健康事业和健康产业发展。截至2026年7月，共有国家卫生健康委重点实验室113个（含委省共建重点实验室25个）。

国家卫生健康委于2018年起将国家卫生健康委重点实验室的日常管理工作委托给中国医学科学院，实行管办分开、政事分离，推动科技体制改革，强化实验室规范管理。受托以来，中国医学科学院始终严格按照《国家卫生健康委员会重点实验室管理办法和评估规则》（国卫科教发〔2018〕32号）的要求，协助委科教司对委级重点实验室实行全过程动态管理。